医院科室齐全，其中，神经内科、耳鼻咽喉科为福建省医学重点学科；高血压、骨科专业为福建省医学领先特色专业；神经病学、高血压、腹部外科、耳鼻咽喉科、眼科专业被福建省科技厅定为优先发展学科。福建省神经病学研究所、福建省高血压研究所、福建省腹部外科研究所、福建省骨科研究所、福建省眼科研究所、福建省耳鼻咽喉研究所等6个研究所挂靠我院。医院还是国家药物临床试验机构，卫生部临床药师培训基地试点单位，设有福建省华侨医疗服务中心、福建省儿童弱视斜视防治中心、福建省新生儿听力筛查诊断中心；福建省麻醉质控中心、福建省危重病监护质控中心、 福建省临床用药质控中心；福建医科大学麻醉学等17个研究室以及福建省医学会骨科学分会等14个专科分会挂靠我院。医院还承担《中华高血压杂志》的编辑和出版工作。同时是首批省、市各类医疗保险的定点单位。
医院拥有3.0T双梯度超导MRI、64层螺旋CT、复合线路SPECT、多功能全数字化X光机、数字减影心血管造影装置（DSA）、高中能直线加速器、三维适形调强放射治疗系统、体外震波碎石机、连续性肾脏替代治疗仪、准分子激光治疗仪、眼底及脉络膜荧光造影、光学相干断层摄影（OCT）、各种听觉检查设备、全自动细菌检测培养仪及生化仪、各种系列电子内窥镜、彩色多普勒超声显像仪、体外循环机、麻醉工作站、手术定位导航系统、超声刀、癫痫刀、第三代气压弹道超声碎石仪、生物波脱敏治疗仪等先进的仪器设备；拥有31间先进的层流、净化和数字一体化手术室，高压氧舱等。可进行脑、心胸、腹部、脊柱等大型手术及异体肝脏移植、骨髓移植、角膜移植、同种异体半关节移植，断指再植、拇指再造、连体婴儿分离术、脑干肿瘤摘除、人工耳蜗植入及调试、屈光不正准分子激光手术、超声乳化白内障人工晶体植入手术以及各种实质性肿瘤的介入、放射治疗等。
医院拥有临床博士后流动站，有临床博士生授权点20个、硕士研究生授权点40多个，有博士研究生导师近20名、硕士研究生导师120多名；并与国内多所著名医学高等院校联合培养博士研究生；与美国、澳大利亚、德国、荷兰、加拿大、芬兰、新西兰、日本等国家以及台湾、香港等地区开展广泛的学术交流，与省内30多家市、县级医院建立友好协作关系。医院现有临床医学教研室（组）37个，临床教师500多人，每年承担着福建医科大学临床医学、医学影像学、医学检验学、药学、护理学、眼视光学、康复医学等专业的临床教学与管理工作；同时，每年平均招收博、硕士研究生130余名。
医院坚持走科技兴院之路，并取得显著的成绩。2003
年以来，该院先后获得国家科技成果进步二等奖2项，中华护理科技进步一等奖1项，福建省科技进步奖近30项；获得国家级自然基金、“十一五”国家支撑计划课题等各级各类科研课题立项300多项。
医院重视两个文明建设、加强职业道德教育、促进医疗质量、服务水平的不断提高。近五年来，先后获得“全国卫生系统先进单位”、“全国医院管理年活动先进单位”、“抗震救灾先进集体”、“省继续教育先进单位”、“省卫生系统廉医廉政先进单位”、省卫生系统“双十佳单位”、省卫生系统“创文明行业满意窗口”示范单位及中央宣传部、卫生部等10多个部委授予的“文化、科技、卫生三下乡”全国先进单位等近30个荣誉称号。
